Simple ITK

Hatice Surumlu
2 min readJan 10, 2021

Sevgili derin öğrenme yolcuları hepinizi selamlıyorum.

Bugünki yazımda medikal görüntülerin depolanmasında yaygın olarak tercih edilen dosya formatlarını (NIFTI,DICOM vs.) açıp kullanabilmemize olanak sağlayan kütüphaneden söz edeceğim.

Simple ITK nedir?

SimpleITK , medikal görüntü analizi için açık kaynaklı, ücretsiz yazılımları teşvik eden ve kar amacı gütmeyen bir eğitim konsorsiyumu olan Insight Yazılım Konsorsiyumunun bir parçasıdır.

Telif hakkı NumFOCUS’a aittir. SimpleITK yazılımı Apache License 2.0 altında dağıtılır.

Simple ITK, adından da anlaşılacağı üzere , Insight Toolkit (ITK) ‘in algoritma ve veri yapılarının daha da basitleştirilmiş bir arayüzüdür.

C ++, Python, R, Java, C #, Lua, Ruby ve TCL dahil olmak üzere birden çok programlama dili için arayüzlerini destekler. Bu sayede bilim insanları görüntü analizi iş akışlarını, en aşina oldukları programlama dili ile gerçekleştirebilir.

Simple ITK, 15'ten fazla farklı görüntü dosyası formatını destekler,280'den fazla görüntü analizi filtresi sağlar.

Simple ITK,

  • CT, MR ve PET ile görüntülenen anatomik yapıların analizinde
  • iki foton mikroskobu (dual photon microscopy) ,odaklanmış iyon demeti taramalı elektron mikroskobu (focused ion beam scanning electron microscopy) ve odak düzlemi dizisi mikroskobu (focal plane array microscopy) kullanılarak görüntülenen hücresel yapıların analizinde kullanılır.
  • Biyo-tıp dışında da çok geniş yelpazede kullanım alanları vardır.
  • Simple ITK, araştırma ortamının dışında, akademik kurumda tıbbi görüntü analizinde kullanılır.
  • Simple ITK sayesinde karmaşık yazılım arayüzleri ile uğraşmadan algoritmalarımıza daha fazla odaklanabiliriz.

Hepinize asude günler dilerim …

--

--